NONHSAT004062

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References

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Basic Information

Transcript ID

NONHSAT004062

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

intergenic

Length

11288 nt

Genomic location

chr1+:78444779..78456066

Exon number

1

Exons

78444779..78456066

Genome context

Sequence
000001 TATTACATTC TTGCGCGACC ATCGTGCCGT AAAGGGGCGG AGACTGAAGG AACAAAATCT CGCGATGTTT CCGAGGCAAC 000080
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002241 ttgagacgga ctcaccctgt cacccagact ggagtgcagt ggcatgatct cggctcactg taacctctgc ctactggctt 002320
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003841 tcgtaaggtg gaacgagaga cttaggaaag aaaaagacac aaagacaaag tatgctgaac cagcgttcag catatggagg 003920
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004161 ctaaggcggt ttttccctat ctcagtagat ggaacataca atcgggtttt ataccgagac attccattgc ccagggatgg 004240
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011281 AATATTTC
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Predicted Small Protein

Name NONHSAT004062_smProtein_8798:9010
Length 71
Molecular weight 8330.729
Aromaticity 0.228571428571
Instability index 75.6542857143
Isoelectric point 6.35626220703
Runs 11
Runs residual 0.0123055162659
Runs probability 0.043142072554
Amino acid sequence MYICIYILYMYIYIHKDFIYIHNIYAYIIYIHNIYAYIIYICVCVYFPPPPDSVSLGHSG
LSAVYNQSSL
Secondary structure LEEEEEHHHHHLHHHHLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEELLLLLLLLLLLLL
LEEEEELLLL
PRMN LLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLL
LLLLLLLLLL
PiMo iiiiiiiiiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTToooooooooooooooo
oooooooooo