NONHSAT001511

From LncRNAWiki
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Transcriptomic Nomeclature

Please input transcriptomic nomeclature information here.

Function

Please input function information here.

Regulation

Please input regulation information here.

Expression

Please input expression information here.

Allelic Information and Variation

Please input allelic information and variation information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this lncRNA

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Basic Information

Transcript ID

NONHSAT001511

Source

NONCODE4.0

Same with

,

Classification

intergenic

Length

14567 nt

Genomic location

chr1-:23607826..23636128

Exon number

17

Exons

23607826..23609606,23609634..23612375,23612717..23613373,23613397..23614403,23615069..23615556,23616403..23616705,23617134..23618573,23620843..23621235,23628018..23628454,23628568..23629258,23629525..23630051,23630576..23630590,23630894..23631491,23632182..23634427,23634627..23635202,23635434..23636049,23636079..23636128

Genome context

Sequence
000001 CTGAGGATTA GTCTAAATTC AAGTATTTAT TCCAATTAGC ACTTTCATTG TTTGAAATTT TATCTTTTAT TAAAAAAAAA 000080
000081 AAAACAGGTT CATAGACTTT TGAGCATTCT TGCAGGCATT GGATAATTTG CATTAAAACA AATAAAATGT GGCTGGGAAA 000160
000161 GCAGACTGCA ATTTATTTTG ACCCACATTC TTTATAAGGG ATAATTTGTG ACTGAAGACC TTATTTGCTG GATAAGTGAA 000240
000241 TGTACATACA GGGAAAATTG TTAGTACTGT GGCGTCAATT GCACTGCGGA CTTTAGTTTT AGTGAAAATG ATCGTGACTA 000320
000321 CCATTTCAGT TACTGGTTTA GGAATATAAT TTCCTATTAC TATGTAAATT TGCTTTGAGA AACATTCATG CCTTGTAAGA 000400
000401 GAGGCTTAAA AATATCCAGT AGTAATACCT TTGACTTTCT GTTAACACTT CGTTTATTTT TATTTATCTG CTATCCCTGA 000480
000481 TGCCCAAATT TTTTGTTGGC CAAGACATAA CATCTATTTC CCTATTTCCT TTAGAAATTC TGATTTATTC TAATGACTTT 000560
000561 TTTGCTTGAG AATGAGAGGA ACAAAAGAAT CTAAGCTTTA CGGTACAGAA AAGTGAATCA CTTTCAAATT ACTATTAAGT 000640
000641 TTTCCCCTCC ATCTTATTCT TACGTGATTT CATTTCTTTT TCAAAGTACA CTCATTACAC AGTATAGTCA TTTAACAGAC 000720
000721 CTTATTGATA TTTTAGTTTT TTGGAAACTG ATAAAGGAAT TATGGTCTGT TGTATGATAG TTTTGAGTTA ACATGGGTAT 000800
000801 TTCTTTGGTA AGACAGATCC AGTTGTTTTT CTTATGCCCA TGTATGCAAG TAAAGACACC AAACATTCTT TAAATGCTGC 000880
000881 TTTTAAACTT TGAAAGTACA ATTTGAAGTT GTAACTATAC ATCTAATTAG ACTTAAGTAA AACCCTGATT TTTTTCCTGG 000960
000961 AAAGAACAAA ATCTACAAAT AAAATTTGAG TTGTTTGTAT TTCTTAATTA GGTGTTACAA GCTACAAAGT TGTCATAAAG 001040
001041 AATGCTAAGA ATGGGGATAG AAATGATTCT GAGAAAACAA ACCCTCGCAA AAACATAAGA TTAAAACTTG GGTTCCATGT 001120
001121 CAAAATCCTT TCCTTTAATT GCAAATTATA TTTTGAATTT TAAAGTGGCC ACCTCCTCCT CTGTCCTTTT CACTAATTAA 001200
001201 AAATATATTT GCAGAGGTAC CCTCTAATAT TTGGTTTATA GGGATTGGCA TTTTTTTTTT TTTAAATTAG GTACAAATTA 001280
001281 TGAGTGTAAG GAATTTGGTT TCCTGCTCTC CTGTCTTTCC ATCTTTTTTG TTCCCCAAGC TAATTGATTT GGCTTTATTT 001360
001361 ATGAGCCTGT TACAGTAAAG TGTGTGTTGG GAAATATATT GAGGTATAGA GCTATTCTTT GTAGGTACCC TGGTGAGACC 001440
001441 GATACAAATA TGCCCCTCCC CATAATGGAA TACTAATTTT TATTTGATCA CTCATTTATA GCAGTTGCTT AAATGTATGT 001520
001521 ATTTATATGA AGGTATTTTA ATTTTTAAGA GCAAAAAAGT TCTAATAAGT TGCCAGATTT CTAATAAATG CAGGTTTATT 001600
001601 TGGTGAAAAG ATAAGGAAAA TGAGTTATGA TTCTGTAGTT TTTTTAAAAT GAGTTCAGCA TAATTGTTTT TCAGGTTTTT 001680
001681 TTAGTTACTG GGGTTATTCT GCATAAGAAA GCCCAATGCT TTCTGATAGT AGGAGATAAT TTTTCTCTCT TTTGACTTTG 001760
001761 AAATCTGACT TAGGAGATGA ATTCTTTTTA AAAAGGTCAG CATGCAAAAA AATAAATTAT ATATTTTAAA TTCTAAAAGA 001840
001841 GAAGGGACAT AAAATTTCAC TCCTAGCATA AAGCCATATA ATATTATTCT TGAAACTCAT TACATCATTT GCCTCCTGCC 001920
001921 CATTTGAATA TAATCATACC TACGTTTTAT TAATTGTGCA TTTGTAAAAC CAAACCCTTC CAGTAAATAC TTGCTATAAG 002000
002001 GCTATTGCTT GTCAATTATC AAGGCTTCTA AATATGTTAA AACTTGTCAT TTTGATTTTT CAAAGATAAT TTTATTATAC 002080
002081 TGAGCTACCA ATATTCTTAA AGAAAACTAA CCAAAGTTAA TATTAGTGTA GTCCATTATT ATGTGGACAA TTATTATGTG 002160
002161 GAATCTCTTA AGTGAGCAAC TAAGAAAAAG CCTTATAGAA AGACTACACT GGATTTATAA GTGTGTTTAT GTTTCTCTAA 002240
002241 GAATGGGAGC TTCTGTTAAC TTAGGGGTGG AGTTGTTCTG AGGAAACCAG TAGATTGGAT GACTGACTGG AGAATCCAGA 002320
002321 ATAACAAATC CATTAGCCAG ACATGTTTAC TTTTATATTA GAAGTTTGTT GATTAGGTCT TAATTTTCAA ACGCAAACAC 002400
002401 CAAGCTTTAA AAATATTGCA TATACAATGT ATTGGTCAGC AATTTAATAA TATTTAATTT GAAGTTAATT ATTGTTAATC 002480
002481 CTTCTAGAAA AGTTTTTTTT CTTTAAATAA AAGTACATAT ATATACTTTT TTATTTAGAG GTTACCAGAA GCTCTGGTTT 002560
002561 TGTTTTGTTT TGTTTTGTTT TTTTGTTTTT TTAATCATTT TCAGATGTTA TCCAGAAATC TGCAAGTGTA CTTTTCCTGT 002640
002641 TTTAACTCCT TCCTTTTATC ACCTGACTAT CAGGGAAGCG AGGTTGAGGC TGCCCTGACC TGACATGTCA TGATGTCGAC 002720
002721 TTGCTAGGTG GGGTTCGCTG GGGACGATAA CCAGTGGAAT TGTTGGTAAG AACTTTTTTT TCCTATTTTT TTTTTTATCA 002800
002801 GTAGTGGGGC ATTAAGTGTG GGAGAATGCC CATATCCTAT AAGTGGGCAA TTATGTCAGC CTTGTAGAAA AATAGGACTT 002880
002881 TAATATTAAA TTATTTTGTT CTTAATAGGA ACATATAATA ACACTTCACT TACTTTTAAA TTGGTAGCAG ATCAGCAGGA 002960
002961 AAGGCCTGCA AGTATGAAGT AATGAAATAC TCAGGGTATA TTTTAAGTGA GCAAAATAGA CACCTTATAA TCTTAAAAAG 003040
003041 TCTCTTGGAG AGACAATAAA TTTGCTTTAA CTGTCATTTC AGTCTAGTAT TATATTTTCT ATATTTTGTT GGATAGATTA 003120
003121 ACATATAATG CATCTTAAAG AGATATTTAT TGCACACTAA TTTTAGTGAA AACAAGAAGA CATTGATAGA ATGGAGGGCT 003200
003201 TAAACACCAA AGATACTATT TTTAAAAATC TTCCAAAGTA ATCTTAACAC TGTAAAATGA AACTTTAAAA AGTTTTAGCA 003280
003281 GTTTGACAAT AATGGCCTCA ATTTAGAGAT ATGTTGAGAC AATGACTTTG GGTCAAGAGG AAATTACATA GCTGAAATAT 003360
003361 TAAGACCTTG AACATAGCAG AAACATAAAC CTATGAACAA CTTGTGTTTT GTGTGAAAGC TAGGGTAGCT GATAGGATTA 003440
003441 GCAGATATTG GTAGAATTAA GAGTCAATAT TTAAATTATT GCTAAAGATG GGCAAAAGGG ACTTCTCTAG CCTCTTCGAT 003520
003521 AATGTAGGTA GACTTGTACT TAGTGAATCC CATTATAATG TTAGGTACTA TGTTCTAAGA CTATTTCTAT AATTGGACTG 003600
003601 AAGGCTCCTG CAAACATAAA TTGCTGATAT GGATATAGTA ACATAAGAAA TACCAAAATA GGGACATTTG CAAGACCTTT 003680
003681 TCCATTTAAT CATCAGTTTA ATAAAAATCA TGCTTTTGGT ACAGTGTTCA TGTACCATAA CTGTATTGGA ATATTTGTAC 003760
003761 GATGTTAAAT ATTTTTAATA AAATTTAACA TGTTCAAAAT GTTGTGTTGG TGATTTTGGG TGGGGTGTGA TGGGTTTGAT 003840
003841 TGTGCAAAAC AGATTTAGTA GTTATGTGAT TTAGGCTTTT GTAGTTAAAT GGAGTTTCTG TCTTCAAATT TAGTACTAGA 003920
003921 TACTGTACCT GTTCTAAGGA AGGTAGTGAA GGAGTAGGAT AGTAAAAATG AAAAGGCTGA ACTCCCCAGA GATTTATTAA 004000
004001 ATTGCCAGGA AGCTTGACTG AGGTTAGAAC TAGATCTACA GGTGGCAGAT AGGAATATTG GCTGTGGCAT AACAGGCTGC 004080
004081 CAATAGATAC AGTGGTTTTT CAAAGGGTTG CTTAAGCTTT AGCTGTACCA AAAGCCCCGA ATTTATTTAG TTTAGTTTTA 004160
004161 GAAATAACAA GATTTTGTTA GGTATTTTCC TGTGGAGTAT ATTATATTCA CCTAGGGAGA TATCTTCTGT CTATAGCTAT 004240
004241 GAAAAGAAAT TAAATTTCTA TTTCCTTGTA ATTGAAAGTT GTGACCAAAA TCAAGACCAT GTGTAGACAT TTCCTCTAGC 004320
004321 TCATAAGCAA GAGTAGTGTT TTATTCAGCT GTTTACTTAA AATTCCAAAT GGTGACTTTT AGGCCTAGAT GTCTATTTGT 004400
004401 TAAGAGGCAG GAGGGGCTCT GTGTGGTGGT GGTTCTTGCT GGTAATCCTA GCACTTTGGG AGGCCCAGGT GGGAGGATTG 004480
004481 CTTGAGCCCC GGAGTTCAAG ATCAGCCTGG GCAACATAGG GAGACCCCAT CTCTACAAAA AATCAGAAAC TTAGCTGAGC 004560
004561 ATGGTGGCAC ACACCTGTAG TCCCAGCCAC CGTGGAGGCT GAGGTGGGAG TATTGTTTGG GCCTGGGAAA ATACTGCGTT 004640
004641 ATTGCAGATC TCAATACTGT TTAATAGAAT TTGGAAACAT TCCTGTACGC GTGTTCTTGG GAGATTATTC TGTACTTCAG 004720
004721 TTAGGAATCC TTTAAGTCTG TAAACTTCAG TTTCAGCCTA GGTTTTTAAG TAGATTAAGC AAAGTTAATA CTTTTCTTTT 004800
004801 CTTTTCTTTT CTTTTTGAGA CAGAGTCTCC CTGTGTCGCC CAGGCTGGAG TGCAGTGGCG CGATCTTGGC TCAGTGCAAG 004880
004881 CTCCGCCTCC CGGGTTCACG CCATTCTCCT GCCTCAGCCT CCCGAGTAGC TGGGACTACA GGCGCCCGCC ACCACACCTG 004960
004961 GCTAATTTTG TTTTTGTATT TTTAGTAGAG ACAGGGTTTC ACTGTGTTAG CCAGGATGGT CTTGATCTCC TGACCTCGTG 005040
005041 ATCTGCCTGC CTCAGCCTCC CAAAGTGCTG GGATTACAGG CGTGAGCCGC CACACCCAGC CATTAATACG TTTTAAAAGG 005120
005121 CCACTATTTT TATCAGCTAA ATCACTTTTG AAAATTTTGT GTGTTATGTG TTATACTCAA AATATTATCA AAACATTCTG 005200
005201 TTTTCATTTG AACCTATTGA TTAGAATGGT GCTTATTTAT TTGGCTGTTG TTCAAGTACC TGAATTGGCT TGGTCAGAAG 005280
005281 GACTTGGGTG TTCTAGCTAG CTGTCGTATA ACTAAATATA GAGTTGGTAT GGAAAACGAT TTGATCTAAA TACAACCAAC 005360
005361 AATAAATATT TTTATTGAAA CTTCCTTTTA ATTGATGAGT AGTAATATGG ATGTCTTCAT TAGTTGTAAT GTCATTTCTA 005440
005441 TTTTACTTTC CTAAATGTGA AAGAAAAGAT GAAAGACCAT TTCTTGGACA TATCAAATGA TTTTTAAGGA ATTTCTGGTG 005520
005521 ATTATTTAAA TTTTCTAGTT AAGCTGTCTA GGTCAGAATT CATCATTCAA AAATGCTGCT CAAACTTGAA GTGGGTAGGA 005600
005601 ATTTCTGGGG ATTTTGATTA AGATGCAGAT TCTGACTCAT TAAATCTGAG ATGGGCAAGA GTCTGCATTT CTGACAAGCT 005680
005681 CATAGGTGAT GCCAGTGTTC CTGACTACAC TTTCAGTAGC AGAGTTACAG ATTATCCCAC ATTTTGGGGG ATTTTGTGTT 005760
005761 TTTAATAAGA TTGAGCCAGG CTGTGGTATT TTATCTGCAA CTTACTACAA TTTTACGTGT AATTCAATTT TATCCTTAAC 005840
005841 TTCTTCTCTC CAGATTGGAG TTCTTATTCT TTGAAGTCAA AAGCCACTTT ATTTCTGTGA ATACTTCCTT TTCACTGTTT 005920
005921 TGTACCTTCC CTGGCTTTCT ATTACGTCTT TGAAGTGGCT ACTGGAAGGT AATGAAGTAT GCTGGATGCA TATGTATTAA 006000
006001 CCATGGTTTT GTGTCGTGTT AATCATCCTT AAAAAAAAAA ATCCTTCCAA ATTATCCCCA GTTGTTATCT TTCTGTTTGT 006080
006081 GTGTGTGTGT GTTTTAGAAG TGAGGCATTA GGCTGGGTGC GGTGGCTCAT GCCTATAATC CCAGCATTTG ACAAAATTAA 006160
006161 TTCATATTTA GTCTAATATA TTCCAAAATC CAAGACTTAA TAGGGTAGGA AGCACTGCTG TGGGCCTTAA AAGTTGGTTG 006240
006241 CTAGATTATT ATTCCTCTTC CTCGTCATCC TGCCCAATCC CTCATACTAC CCTATTTGTC CTACGCAGTT GTCATAATCA 006320
006321 TCACACAGAC ACCCACATGC CTACTATGTC ATGGTGTCAA GTTTAAATTC TTGAAGTTTG AGAACTTTCA TATACTTCCT 006400
006401 TGGCATCTTA TGTTTCCTTT AAACCTTTTA TTAATTTCCC AATCTGTCTG CAATTCTGCC TAAGACTTTT CTGTCATCCT 006480
006481 TAGGAAGGTG ATGCTGATTT TTTTCCCCAT ACTTTGGTCC ACCTTTCTTT AACCCATTAC TTTCTAGCAA TTATTTTGGC 006560
006561 AGTTATTTCA TTTTCCTAAG ACAAAGATTG GAATGTGTTG TCACTGATGA AATAATAGAA ATATATGGTT GAGTCATGTA 006640
006641 CAAAATAACT TACAGGCCCC AACCAGTGGC CCTCTTCAGG GGGTATTTGG AATTATTTAA GTGACAGACA ACAAATTTGG 006720
006721 ACTGAATCTT AATATCTAGA TTCTGTGGGT AACAAAATCT GTAAATAGAA AATAATAAAA TGGTTAGGAT TAGTCCATAT 006800
006801 GAGAGTTTGC GTTCAGAGGT TTGGAGGGCA AAACTGACGA TTTCCTGCTC TTGACTATTA TAGAGCAGTC TCTTGCTTCA 006880
006881 CAGTTGTCAA AATCCCACTT CATGAACGAT CACAGACCAA ATGGCAGAAA ACAACCCAGT TGTTTTCCCA GTTGTTTCTA 006960
006961 TTCCTAAAAA TTGCATAGGT GGGTACATAT CGTATTCTGT TGTGTTTTCT GAAAGCAAAG GTACTGTCAT GTTATTGTGG 007040
007041 TCTATGTGCA TATCGCTGTA GTTATCCATG CTATAGGTAA AACTGTTGAA AAGAATTATT TAATTGTGGT GATAAACTGC 007120
007121 CTTAGACGGA GTCTGTTAGA CGTGCCTTCT TATGGTGTTT ATGCCTTAGC TGTCTCTTCC TGAGGAAATG TATGAATAAG 007200
007201 AAAGGCTTCT TGATATTTTG ACCTTAGACT TGATATCTAA TGCAACACCC TTCCTCCCCC ATTTATAGGA ATAGTACTCA 007280
007281 TTCATTGAGT ACTATTATAT GCCAGACACA CGACGCTAGG TGGTTTGTAT TATCTTTATA TCCACAATAA CCTTGATTTA 007360
007361 GGTAGTAGTA TCCCTGTTTT ACTGTGAGAA AACTGAGGCC CAGAAAGGTT AAGTGATAAT TGTATGGCTA GTTTGTGATA 007440
007441 ACTATAGATA CTACAACTAA AAATTTACCT TTCTGGTTCT TTTTTTTCAT TCTTACCTTT CTCTAGCAAT ACATATTTAG 007520
007521 CTCTTTAGAG CTAGTTACAA TATATTTTTT ATGTTAGACT TACTGTGTGG GGAGTTTTGA ATTTAAAAAG CTATTCTGAA 007600
007601 AGTTAAATAT CATTAGATAC ATTGTCAAAC CCTGAAGCTG AAATTCCAGC CATTCAGGGA GCCCCTCAGG GAGATCACTG 007680
007681 CTTTTCCCTT GCAAAAATAA AAATAGTGTA TAAAATACTA TTTAAATATA TACTCTTATC TAATTCTAAT AGCTAGTATT 007760
007761 TGTTAAGTGC TTAGTAAGTG CCAAGTGCTG TTCAAATTGC TTTTTAGGCT CACACCTGTA TAATCCCAGC ACTTTCTGAG 007840
007841 GCCAAGGTGA GAGGACTGCC ATCTTGAAAT TTTTTTTTTA AAGTACTTTT TACTGAAAAA AAATTGTTTA TGAAACAATT 007920
007921 TAAATGATAT TGTTTAAGCC AAAACAGTTA CTTATATTTC ATTTCTCTTT TATTTTTATA AATAGAGCAT CAATTCCCTT 008000
008001 AATCACAAAG GTCAAGAAAG GTTATCTCAT GTTACATTAG GACATACTTA GGACTTCGTA GTATTTCCCT TCTGTGTGAA 008080
008081 ATTTTATCCA GAAGACTTGA ATTACTTAAT CGTAAAGTGA ATAGCAAACG TGAATCTAAA ACATGGTTTC AGTTTTTCAG 008160
008161 AATCAGGCCT GCTTTGTCCC TAAATGCTTT CTTATTTCCC CAGAGCCCTT ATTGGATTTA AGCCCCATAT CATATCTCAC 008240
008241 ATACCTGAGA CAGACATACC ACAGTGAACC CTGCATGTCC TTGTAAGTTC TTTTCCGTGC CTAGAAGTTG CAGAAGACCA 008320
008321 AGGAACCTTG GAAGTGACTT ACTCTTTTGC TTCATAAAGT TGCTTTAAAA CAGCCTTTAT ATATATATAT ATAAATTTGT 008400
008401 TTCATAAAGC AAGGAGAAAT GGTGTAAATA ATACAAGTGT GGCTATTGAC ATATGAAAAT GTCCATTTAT TTTGAAAGTG 008480
008481 ACTACCCCCA CAGATTATAT AACTGTAGAA TCGAATACAA ATTTTCTCAC TTTTCTTCCT TGCTTTGGCA TTTTTTTAAA 008560
008561 AGTTACTTGA AAGTTCAGTT TAGATTGAAA AATAAGGGCC TGATTAATAG CGCTGTATCA TGGTATTAGA GTACATATGT 008640
008641 TAGTATTTTC ATGAAAGAGG AAGAGGGTAA TAACTGATTT ACCTATGATT AAAAGATAGT GGTGACATTT TCCTTTGAAA 008720
008721 GTTTGGGCTA GAAATTTATA ACCTTTGGCC AATGAAACTA CAGTAGCTTC AGTCACTGCT TCCATGCCAC ATCTCTACCT 008800
008801 AAAGGGAAGA TGGAATCCGC CTTCTCTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTCT GAGACTGAAT CTCACTCTGT CGCCCGGGCT 008880
008881 AGAGTGCAGT GGCATAATCT TGGCTCACTG CAACTTCCAC CTTTCAGGTT CAAGCAGTTC TCCTGCCTCA GCTTCCTGAG 008960
008961 TAGCTGGGAC TACAGGTGCC TGCCACCACA CCTGGCTGAT TTTTGTCTTT TTGGTAGAGA TGGGGTTTCA CTGCGTTGGT 009040
009041 CACGCTGGTC TCGAACTTTT GACCTCAGGT CATCCACCCG TCTCAGCCTC CCAAAGTTCT GGGAGTACAG GCGTGAGCCA 009120
009121 CCATGCCCAG CCTGAATCCC CCTTCTCAAA AGTAACTTCC ATTCACTTTG TCCCTGGCAG TCTGCTGGTG ACCATGATTT 009200
009201 CTAAGGCTCA CTCATGGGAC CAAAGGCAAG AAGAAAGGGA GGAGGGTGGT AACCAGATAA ACTTTGCAAC CCCTTTGATA 009280
009281 GGACTTTTTG GGTGAGAATT TTTATGAAAA GTAATATATA CTTCTACTAT AGATCTGCCT CTAGTTTCAA CCTCTAGTTT 009360
009361 TAGCACTGAT TTTTTCCCCT TAATTTCTTC AAAGAAAGTG GGAAGAATGT CCACAGATGT TAGGAGAAGA CAATTATGTA 009440
009441 GGAAAAATAT TTTCTCAAAT TAAAATTTAA AACAAAAGTT TGCAGGGAAT GGAGTGGGGT TCAGCATTAG GGAGGTAGGA 009520
009521 GATGATAAAA ATACATATTA AGTAATTTGT ACCCTGATAT GCTTTGTATG TAGATTGCTT ACAACTAACA TGAAATGAGC 009600
009601 ATTTCATTCC TTAAGCATGC TGTTGGGGGA AAATGGGAGC CAGGCTGGAT GCACAAATTT ACACCAGATG CTCTGTATCC 009680
009681 AGGTAGCAGA AATGACTAAC AGCACTGGTA TCCATCAGTC CCAGAGCAAA AGCGTCTCCA GAGGAGGACA TCTGTAAATC 009760
009761 CCAAATCTGA TCTCCTTCAT CATCATTAGG CAACAGATAG GATAAGACTT CATGAAGAGA ATTTTGGTGG CTTTAGATTG 009840
009841 TTGAGAAAGT ATATATAGGA AAAAACTGGA AATTATGTCC AAGATTTTTT GTCTAACTCC TTATCCTGAT ATTGTTAACA 009920
009921 TTTCACAACT AAAATAATTT TAACAGACAA TTAGTTTTTA AAAATGTATT TTCATGACCT GAGACTACAG AAATTGCCAT 010000
010001 TTTCTTAGGA CGTAGTTTAC ATTTGACTCT GCTTACTGTG TCCATATAGG CCAGAGAAAT ATGGCTGTTA CGATGAAGGC 010080
010081 GTAACTTCTC TGGTTCTTGA TTATTTACAC CATTAGAGAA GAATGCAAAT ATGAATAGCT CAGAGTAGTT TAACTTTGAA 010160
010161 GTGAGAGTTT ATATGCACCT TTATATGTGG GATAACTGAT GTCTTTGGAA TAGACTTCAA ATGAATGATA AAAACACCTG 010240
010241 TAAAGTGATA GGACCTCTAC TTTTTCTCAT GTCCAATGTT CAGTTTCTTA TAAACCAGGC ATGAAGAGAA ACAAAAAGTA 010320
010321 ATTAATTCTC CAGATCATGA AGTTGTCTTC AACCTAAGCA CAGAGGTATA ATAATTACAT TTCTCAGAAG TTCCCCCTCT 010400
010401 GTTTTGAGTC TCAAGGGCAA TTGAGATGTC AGTGAGGCTG TGATTAAATG TATTGGATAT TAGAGGATTT TAAATACAAA 010480
010481 CAAGTATTAT AGGTGTTACC ACTGACCCCG AAGGTAAGAT TTACTGTGAA AATTTATAAT GCAAGGAAGA ATGATCAAGT 010560
010561 TGGCTGTCAG AACAACAAAA TATTACAAAC CAGGATGTCT AAGAGCAGAA GTCCGTGGTT GCCACCTCTC AAGCCTCTTA 010640
010641 GCTTAATCCA ATCTAGGATG CATTTCCACT CTGCAACAAA CAGTATTTAT TTTTGCCTTA TTTGCAGATA ACAGTTTTAA 010720
010721 TGCAGGTACT GCCCATGGAT TAGCTTTGAG CAGTGTCTTT TTGCTTTGGT TTTTTTATTT GTTTGGTTTG TTTTGAGACT 010800
010801 GAGTCTCAGT CCTCCAGGCT GGAGTGCAGT GGTGTGACTT TGGCTCACTG CAACCTCTGC CTCCCGGGTT CAAGCGAGTC 010880
010881 TCCTGCCTCA GCCTCCCAAG TAGCTGAGTC TACAGGCGTG AGCCACCATC CCCGGCCAAG CAGTATCTTT TTGCTTTGAA 010960
010961 AGTGACTTAC ATGTACATTT GTTTTCCTTG TGAATGTTTC TTTTTAACTG CAAACTAAGA AACATTGAGC CCAGCATTCA 011040
011041 TATATTTGCA AACTCTGTCT TACTTAATTT CTCAGTTTTT TTCCTCAGAA AAAATGAAAT TCCTTTTCTT TTTTAAATTT 011120
011121 ATTTTTTCTT TATTTTTCTT TATAAAGTGA AGAGTAGGTA GCATGAATTC CTCTTGCCCT TTGCTATTTC AGTCTGGCAT 011200
011201 CAGTAGCAAT TGTTGCTATG TCCAGTTTTC ATTCATGGAT TTTTCTGGGA TTGAAGATGA GTTCAATGTT GATTATTTAA 011280
011281 TTGGGCAGTA TAAGTAAATT CATTGGCTCT CCTTCCAGTT TAGTGAATAC TAAATATCAT CCATGATATT TTATACTTCT 011360
011361 TACACTTCTG GAATCTAACC TGAAAATAGA AGTTGTAAGT CAGGGACGGT GGTATGTGCC TCTAGTCTCA GCTAGTTGGG 011440
011441 AGGCTGAGGC TTGAGCCCAG GCCTTCAAGG CTGTAGTGCA CAATGACTGT ACTTGTGAAT AGCCACTGCA CTCCAGCCTG 011520
011521 GGCAACATAG CAAGACTCCC ACCCCTTAAG AAAAAAGAAG AGAGAAAAAA ATAGAAGTTG TGGAGAGGGA GGAGGATGCT 011600
011601 TGAATACTTT GACCGTACTT GGCATAATAG ACATTTTGAG GGTTTTTTTG TTTTCTTAAA ATTCCTCTGG ATCAGTTTTC 011680
011681 ATTGTTTCTA GTAATTATAT TTATCGTTAA TGAATTCATA TTCTGCTCTA GCCCCTAAAG ATAGTTTGAT ATGCTAACTT 011760
011761 TTGTTTTGCC TTTCTAGCTG CTAAGATAGA TAATGGTTAT TGCAAAATGC ACGTTTTTAA ATGGTCTCCA GTGTGGATTG 011840
011841 CTTCTGAGCT GCTGATGGAT TGAATACATT GAGAAGGAAT GTGTCATTTG GAATCCAGGA CCAGTCAGCA AGGATAACTG 011920
011921 CCTGATTTTA TGGTCAGAAT GCTCTAACTC TTATGGCATA CTGATGACTT TTTCTTCCAT TTTCCAAAAA AGCAAGTTTT 012000
012001 GTCAGTCTCA GTGTTTCTCT GATCTAGCTA CTCACAATTC CATTCCCAAA GTAGTGACCT AGTTCTGTCA CTTGGGTTTC 012080
012081 AAAGGGAGTT GAAGTGTCAC TGAGTGAGTA CAGCAAACCT GTTTAATGAT TTATAGGAAG CAAATAAAAA GAATTTTGTT 012160
012161 TGCTAACCTA GAAGTATATC AGATTTTGGT TTCAATTTAT AATTTTGCAA AATATAAAGA CATTTCCTGG CTAACTCCAT 012240
012241 CCAGATGAAT TATTCAGTAT TTTTTCTCCT ATCTTAATGA AGTTAATTTG AATGCTAATT TCCTATAACC AAGAAAACAG 012320
012321 TTGAATTAAA TAACCCTTAT CTTTTAAACT TAAAGCTTAT ACTACTAATA ATCATTTAAC ATTCACTTCC TTTTTTCTGA 012400
012401 CTTAATTGGT AGGTAAATAA AATACTTCAA ATTTGATTGG CAAATTGGAA AATCACTTAG AACAATCTGC TAGTATTTTT 012480
012481 TATTCCCTTT GTTTTTTCCT TTACACATTT GTACTGCAAA ATAAATCAAG GACAAAGACT CACACTGAAT TGATCAACTT 012560
012561 GTGTTTGGTC TTCATGGGAA TTACATCTTT TTTCCCCTCA ACATTTATTA AAGGAACATA CAGAATTTCA GACTATAGCA 012640
012641 AACTAATACC TTTAGCTTGA CTAAGAGTTG ATTTTCGTTA AGGAACAGAA CTTGTAATTT ATTTCGACAT ACTTTAATGT 012720
012721 ATGACTCATC CCTGTTAAAG TTGTGAGACT CAAAACTACG CCCAAATCAC TTAATTTTAT GTCCTTATTT CGTGACTGAT 012800
012801 GCTGAAATGG AAGCCAACCA CTGCAGAAAT TTGGGGGAAA ATGAGATCTG AAGAATACAA GGGGAAGTAG GAATTCATTT 012880
012881 CTAGCATTTC CAAACCTGCT TAATCGTGTC TGCTCCACCA CAGTCAGAGG AAAAGACTGA GTTCATGGAA ATTACCAGCT 012960
012961 AAGCCTTACA TCTGTCTTTA ATGTTTTTAG GAAGTATACT GAAAAGGTAA GTGAGATGTC TGTTTTGAAG AAAGACTCTT 013040
013041 ACTGGGTACC TTAAAACCCG TTGTTTCCTA TTAGTAAAGA TGGGCAGCTT CTTTATTCCT AGCTTCAAAA AGCCTTGCCC 013120
013121 CTGTTTGGTG TGTTTCTCAG TATTGTGGAG AAGGTAGTTT CTGAGCAAGG TGGTGCTTTT CCTCTGCTTC TCAGCAGCTA 013200
013201 AGACAGAAAT TGCACCGAAG TGTACAAAGG GCCAATTTTT GTTGTCCTGT TGTGCTCAAA TCCTTTTTTT TAAAAAAGTT 013280
013281 ATTTCAATCA AGTCTTAGTT TTATTCCTCA CTATATAGGA AAAAAATCTT TAATGCCTCA AAAGTTCCAT TCAGCATTAC 013360
013361 ATTTGCATTA CTCTTATTTG CAGCAAATAT GAGTAAAATT ATAGGTTTTT AAAGGTCTCT AATAACATCC ACTTATATTG 013440
013441 GTTTTGTAGA TAATCCATAA ATTACCAGAA ATAAATTATT CCACATTTAT TACACACCCA TGTAATAGAT GTCGTGCCAG 013520
013521 GCCCTGGAAT ATACTAATGG CATCACCTCA TGTGGTAAAA AGACACATTC CGCCATCCTG GAGTATACAA AGGTAGACTA 013600
013601 GCATATAGTT CATGTGCTCA AGGAGTTCAT TTTTATTGAC ATGATACAGA TAGAATTGTA GTTTAGGGAA TCAAAATCTA 013680
013681 ATAAAATGAG GCTAATTCCA TTTTCCCATT AACACTAATA ACTAGTGTGT AAATCTGAAT ATGACACATT CTATATGAAA 013760
013761 GAAGCTCTGT GTGCATCTAC ACTAAATACT CGTGTGTGCC AGGTACTGTT TTAAACTACG TATATTTTTT TAATTCTCAT 013840
013841 AACTGTTCTC TGAGGTATGT ACTAATACTA AAGCTTATTG TTAAAGGAAG GCAGAAAAAT TAAGTAACTT GGCCTAAGTT 013920
013921 TGCATAACTG TGATCTGGGA TCAATATTTG AACCCATACA GGCTGATTGC AGAGCCTGCA CTCTTAATTT GAGTGTGATA 014000
014001 TTTATGTGCA GTACCTGGCT ATAAGTACCC ACAAAACGTT TCAAATTCTT TATAAAATTT GCTTAGTTAA AAAAGTACCA 014080
014081 ATTGCATAAT ATGGTTATAA GTCTGGTAGA AGTTAGGCTT TTTACAAGAC ATGCTGCTTA CTGCACCAAG GAGGCAAGAA 014160
014161 GGCTTTTTAG AGAGCCCAGA ATTTCCTTTC CTCAACTCCT GCTTCCAAGA CAGTCATTTT GCATGATAAC CGTTTCCCCA 014240
014241 AAAAACACAG ACACAAAATT TAAAGAACTG GAACAGAGGA AGCAGAGCTT ATCATAGTAT ATATGTTTAG TACCCTGTCA 014320
014321 CTTAGGTCCA CCCCTCTTTC TTTGTGGATT GTGGACATTT TGTTTAACTG CTAAATCATG AGAATATATG ACTGCTGAGA 014400
014401 CTTTTCCAAG GATTTTTTAA AAAACACATT AGGCTTTGTG CAGAAGTAAA GAAAAAGTGC TGTGAGAACC CCAGGTAGGT 014480
014481 AATTTACTTT CTATTGTACT CATAGTTTGT TTGAAACCTC TTCACCTCTA TCCCTTATTG TTTTATACTC TGTAAATCTG 014560
014561 ATTTTAC
[back to top]

Predicted Small Protein

Name NONHSAT001511_smProtein_14090:14296
Length 69
Molecular weight 8071.4339
Aromaticity 0.0882352941176
Instability index 62.6661764706
Isoelectric point 10.284362793
Runs 9
Runs residual 0.00814785373609
Runs probability 0.0360065948302
Amino acid sequence MVISLVEVRLFTRHAAYCTKEARRLFREPRISFPQLLLPRQSFCMITVSPKNTDTKFKEL
EQRKQSLS
Secondary structure LEEEEEEEELHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLLLLLLLEEEEEELLLLLLHHHHHH
HHHHHLLL
PRMN -
PiMo -