N4BP2L2-IT2

From LncRNAWiki
Jump to: navigation, search

Annotated Information

Approved Symbol

N4BP2L2-IT2

Approved Name

N4BPL2 intronic transcript 2

Previous Symbols

_

Synonyms

CG030

Chromosome

13q13.1

RefSeq ID

NR_026928

OMIM ID

_

Ensembl ID

ENSG00000281026

pubmed IDs

8812419

Sequence

>gi|223941925|ref|NR_026928.1| Homo sapiens N4BPL2 intronic transcript 2 (N4BP2L2-IT2), long non-coding RNA

000001 AGTACCCCTA TCTGAAATGC TTGAGACCAG AAGTGTTTTG GAGTTCAGAT TTTCTTTTGG ATTTTGGAAT ATTTGCAGAA 000080
000081 TACCTACTGA TTGAGCATAT CTAACCTGGA AATCCAAAGT GCTCCGGTGA ACATTTTCTT TGAGCATCAT GTCAATCAAT 000160
000161 GCTCAAAAAG TTCAGGATTT TGGAGCTTCT TGGATTATGG GTGCTCAACC TGTATAGGAA ACGTGGAGAT GGAGCATGAA 000240
000241 TCAGTTGTAT TTGATACTTG CTGGGGAAAG GATTTCCAGA CCACCAGAGA AGAAGGATCA CCCATTTAAC TTGGTGTATC 000320
000321 CAGTGCCATA TCAGAGCCTT TTCTTCCATT TTAACCTCAC CAGTAGTCTT TAGATTTGTG GTTTATGATC AAGAAATTAA 000400
000401 ATCCTAGAAT ACAGATTAGT AGAGCAAAGT TGAGGCTTTT GATTATCTAT TTCTTTTAAG GTTTTTCGCT TTAACACTTT 000480
000481 ACAGAAGAAT TTCTAGACTG TCTGAGAAGA ATACTCCAGG TATTTGTCCC AGTCTTAAAA TGGTTCAACA AAAAGTTCAT 000560
000561 AATCACTTTT TAGAACCCTT TTCCCAAAGA ACTGTGATCC TACGTGTAAC TTAAAAAAAG AAAACACACA AATGCTTGCA 000640
000641 TCTTTTTTCA CATATTTATC TGTATTCAGC AATCAAGAAT AGCTGGTACT GATGGATATC TTTACATGAT TTTTCGTTAT 000720
000721 TTATCTGAAA ATAATATATA TTGGGTCATT ATTTGGCTTT TCAACCTCAG TAATTCAGTA ACTTTCTTTC AGTTAATTTT 000800
000801 GTTGACCTGT TTTGGACACT TTTCAAAATA TTCTTAGCAT GATTTTACTG GGAAGAACAC ATTATTACAA GAGTTAGGCA 000880
000881 GTCTGAGTTC CACCTCCATT TGTGTCCATC CTCTCTCGTT TGTTTATTGA ATGCCTTCAC CTGTGCTCTG AATTGCATCT 000960
000961 CTTTCCTTCT CAGGAAATTT TATACATTGT CAATTATTCC TTCTCTCTAA CTTCAACCTC GCCTTCTTTG CTGAGTCTGA 001040
001041 CCCATCAACA GTTAAACATG ATCAAGTCTT CCGATTTAAA AGTCCCTCTT TCTTGACACA GCTCATTTAT AGCCAAACTT 001120
001121 CTTTCTGAAG AGTAGTCTAC ATTCATTTTC TTTTTCTCCC TCACTTCTGA TAATATTGAA CCAACTCCAT TTTAGTTTCT 001200
001201 GTCCCTATCA TTCCTCTAAA TTGATTAAGG TCTCCAGAAT ATTCCTCTGT ATTTACGGGC ATTATTCACT GCTCTTCTTA 001280
001281 TTTGACTACT CAGCAAGCAT TTAACTTTTG ATCAGTTTTT CCTTAAAATA CTTTACTTGG CTTCCTTGAC ATCATGGTTT 001360
001361 TTGTTCAGAT CTCTGTGGTT ATTTCTGTCT CCTTTGCTGC CTTCTCCTCT TGGTCCTTGA ATTTTAGAAT TCTTCAAATT 001440
001441 TCAGTTCTAG ACAATCTTCT GTTCTTACTC TTAGCTTTCC CTATGTGGTC TCATCATTTC TCATGTGGAC ATAGTAGTCT 001520
001521 CCCCACTTTT ATTTTTGCCA CCTTACAATT TTATCCACAG AGCAGCTAGA GTAGTCTATA AATTCTTTTT AAAATACGTA 001600
001601 AAATCACTCA CTGCTTAGAC ACTACATAAT CTAGTCCTTG GCTGCTTCTC TGACCCTGTC TTATACCAGT CTGCATTTAC 001680
001681 TACAGTCCAT CTATACTGGC CTCTTTGAAC TGTTCTTCAG ATATGATAAG CTTGTCCTTG CTAAAAGCTC TAACTGTTAT 001760
001761 TTCTGCTTGG AATGCTCTTC TCGTCTACTC TTCCTATGCC TAGCATTTTC TTAATGTTTA GGTCTCACCT GAGATGTCAC 001840
001841 TTTCACTGTA GTACTAGTAG TTGATGTTAC TACTGATTCG TTGGCAGTAT TCCTGAAATA GAATATAGGA TAAATGAGGA 001920
001921 CATGTTTATT TTGTTCACAG CTGTGTCCAC AAAATCTAAA CAGTGCCTGT AGTACTGTAG GAGCTCATTA AGTAGTCGGC 002000
002001 TGATTGATTT TTGTACCTAA TGGTTCTATT AACAATATTG ACCCCCAAAT GTATTTTCTT CATAACCTTC TCCTCTGAAC 002080
002081 TCCAGTCTGT ATATTTAACT GTCTACCTGA CATTTCCACT TCTAAGCTTA AAAGCTCCTC CAATTGAACC TGTGATCTCT 002160
002161 TTAAATCTGG GACTCCAGGA TTTCCTGCCA CAGTGAATGG ATTTACCTTT TATCTATCTC TGTAAGCTAG AAAGTTGAGA 002240
002241 GTCTTCTTCA ATGCCTTCTT TCCCCCTCAT ATTCAATCCA TCAAATGGAT TCTATGGACT TTGCCACCTG AATATCTCTT 002320
002321 GAATCTGTTC CTACATTTTA AACTACCATC ATTTGATGGA TTTTCACACA GTGAGTGTAT CTATATAATT AATACCCAGG 002400
002401 TCAGGAAATA CGATATTACT AGCACCTTAG AAGCTCCTTG TGCCCTCTCT CTGTCAGAGT GATCTTTTTA AAGGGAAAAT 002480
002481 GTGATCATGC TTAATGCCTT TCAGTTGCTT CCCATTGCTC TTAGAATAAA GACCAGAAAT CATAATGTGA TATTTAAGAT 002560
002561 CCTGGATGAT GTTACTGTTT TTCCTATGCA ACTTCATGTT TTTTAAATTA TTTTTCTCAC TTTCTGTATT CCAGCCCTGA 002640
002641 TAACCACCTC TCAATTCCTT GAATGTGGTA TGCTGTTCCC TCTTGCTAAA AAATTCTATG TACACATACC CCTTCCGTTC 002720
002721 TTGTCCTTCA GATTTGAGCT CTTCAAAGTT TTCTTGGACA TAGCAAGCTT GATGAGGTCC CAAATACATC TTATGTGCTC 002800
002801 TCATATGCTT TATTCATTTG TATATTATTA TTTCCCTTAT TTTTAAGCTA ATGAGTCAGG TATTACACCT GTTTTGCTCA 002880
002881 CTGTTGCTTG GTCATCAGCT AGCATGGTGG CTGGGAAAGA TTAGTATTCA ATATTCATAC AATAAGTGAA TATGAGTAGT 002960
002961 TTGGGTTTGT TATGGGATGA ATTATCCATC CCCACCCCCC ACTCCCACAC ACAGACACCC AACTGATACA CTGAAGATTG 003040
003041 AAATTCTAAC TGTAGAACCT AGAATGTAAC TGTATTTGGA GATGGGGCCT TTAAAAAGGT AATGAAGATA AAATGAAGTC 003120
003121 ATATGGGTGG ACTCCAATTC CATATGAGTG GTTTCCATTA AGAAGAGATT AGGACACAGA CACACAGAAA GGTAAGACCA 003200
003201 TGTGAAGACA CTGGAGGAAG ATGGCCATCT ACAAGCCAAA GAGATCTACA GGCTTTAGAA GAAACCAACA CTGCTGACAC 003280
003281 CTTGATCTTG GACTTCTAGA AGTGTGAGAA AATAAATTTC TGTTCTTTAA ACTACCCAAT CTGTGATACT TTGCTATGGA 003360
003361 AGCCCTAGTA AACTTATATG GATTTTGGTA TTGGGAAAGT GGGGTGCTGG TGTAATTAAT ACCTAAAAAT GTGGAATTGG 003440
003441 CTTTAGAACT AGATAATGGG TAGAGGCCAG AAGAAGTATT TGTTAGAAAA AGCATAGACT GCCTTGAAGA GATTGTTGGT 003520
003521 AGACATATGG ATGTTGAAGG TGATTCTGGT GAAGCTTAGA AAATAGGAGA GCTGTTGAGA AAGCTTCTGT CATCTTAGAG 003600
003601 GTATACATAT GTCACCTTGA ATAAATATTG GTAGAAATAT GAATGTTAAA GGTGTTTCTG GTAGGAACTC AAACAAATGA 003680
003681 GGAATATATT GTTGGAAACT GAGGGAAAGG CAATGCTTAT TATAATGTGG CAAATAGCCA AATTGTGTTT TGTGGAAAGT 003760
003761 GGATGAACTT ACAAAGTGAT GAACTTGAAT GTTTAGCTGA GATTTCTAAG CAATGCATTA AAGATATGGC CTGGTTTCTT 003840
003841 CTTGCTGCTT AAAGTAAGAT GCAAGAGGAG AGAGAGAAAT TTAAGAAGGA ATTATTAAGC CAAAAGCAAC CAGAGCCTGA 003920
003921 AGATTCGGAA AATTCTCAGT CTATCCATAT TGCAAAAATT TAGCATGTTC TGGAGGGAAC ATCAAAGTTG TTGCAAGACA 004000
004001 ACCATTTCCT AAAGCAATTA GGGATATGTG ACTTGTGGAT CCAATCAGCC ATCTTGGCAG CAACTAGCAG AAGCCAGGAT 004080
004081 AGAGATGGGG TTATACCTAT GGAAATGCTG CTGGCTGGTA CCGAAGGGAA CAGAGGGATA AAAATGAAGG AAGTCTGTTG 004160
004161 GATTTCTTGA GATTCTATAA AATGGGTCAG TAGAGCTATC TGGCTGTGAA CATGTGTTCT TCAAGAAGAG GGAAGAATGA 004240
004241 CCCTGAAGAT GATTGAGAAG GCAAAGGGGC TACTATTGCT ACCACAGGAC CAGAGGGCTC AGGCCTGAGG AGTCAAGGTA 004320
004321 GGCTACTTCT TAGGGCTGAG GGAGGTGGGC TACCACACTG GTGGGCTCAG AAGACAGGGC TGCCACCCCT GTTAGGTGGG 004400
004401 AAGATGGAGA ATGAAGCTGA AGAAGATTAT TCTTGAGCCT TAAAATCTAA TGGGATTTGC CTTTATACGT TTCAGACCTG 004480
004481 CTTAGGATCC ATCACCCCTT CTTTCTGATT TTTTTGGAAT AGGAATGTTT ATCCTATGCC TGTCTCACCA GTGGTGTATT 004560
004561 TTGGAAGCAA ATAACTTGTC TAGTTTCACA GGTTCATGCT GGAGAAGAAT TTTGCCTCAG GGTGAAACCT TGAGTATGCC 004640
004641 TGTACCTGAT CTAAATGATA TTTAGATGAG ATTTGGGGCT TAGAGTTGAT ACTGAAATGG GTCAAGACTT TGGGGCTGTT 004720
004721 GGGATGGAGT GGATGTGTTT TGTGTCTGAG AAGGACATGA ATTTTGAGGG GCCAGATGGC AGAATTTTAG AGGTTGAATT 004800
004801 GTATGCTCTC CAAATGTATA TAAGTTAAAG TCCTAACTCC TAGTACCTAG AATGTGACCA TATTTGGAGA TGGGGCCTTT 004880
004881 AAAAAGGTAA

Predicted Small Protein

Name N4BP2L2-IT2_smProtein_2669:2845
Length 58
Molecular weight 7198.6435
Aromaticity 0.275862068966
Instability index 46.4346551724
Isoelectric point 9.25152587891
Runs 7
Runs residual 0.035903751421
Runs probability 0.0190400484519
Amino acid sequence MLFPLAKKFYVHIPLPFLSFRFELFKVFLDIASLMRSQIHLMCSHMLYSFVYYYFPYF
Secondary structure LLLHHHLLEEEEELLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLL
PRMN LLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHL
PiMo oooooooooooooooTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTTo