CCDC18-AS1

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Annotated Information

Approved Symbol

CCDC18-AS1

Approved Name

CCDC18 antisense RNA 1

Previous Symbols

_

Synonyms

ENST00000440778.1

Chromosome

1p22.1

RefSeq ID

NR_034089

OMIM ID

_

Ensembl ID

ENSG00000223745

pubmed IDs

26421281

Sequence

>gi|300796766|ref|NR_034089.1| Homo sapiens CCDC18 antisense RNA 1 (CCDC18-AS1), long non-coding RNA

000001 CCGCCCGTTC GCGCTGCCAG CAGCTTCCGC CTGCTACGGT CCTGGCAAGC ACCTCGGGAT CCCATTCCTT CACAGGGACC 000080
000081 CTAGCCAGTT AAAGCTGATA CATTCCTGTG GGTCAACTAT GCAACTAACT CAGATTTTGA GCAAACAAAG CTCTCAAGTT 000160
000161 GGTGATCCTC AGGAGTCTCT GCATTAGTTG GACAGCTCTT CTGGAATTAT CTTCTAAGTC AACTGTGGGT TGGGTAGGTG 000240
000241 GCTCTGCTGA TTTTTCGCTG GACTTCCACA TTTGGGACGA GTTGGCTGTC ATCAGCTCTA GAAAGGGTGT GGCCGTTTTA 000320
000321 CATTGGCTGT TTTCCTCACA TTCCTCAAGC AGGTACTGTA ATAAAGAACT GGAGAAATAC AGTCAGATGG GAAGTAGCCC 000400
000401 TTGCTGTCAA GGAGCTTGCC ATCTAATGGG GGAGACAGGC AAGTAAACCA AAGACTACAC AGTGCAGTAT GGTAAGTGCC 000480
000481 ATGATTTTGA TGTGACAGGG CACAGTGGAC GACCTTCCAA ATCAAAGCAA GTAACTAGGG GTTGACAATG GTAAGTATCA 000560
000561 TAGTTGAAGT ATCCTTGAAC AAGGTTTCAG GAAGAAGAAG AAGGGAATTT CATGCAGGGA AACAGCCAAA GCTCAGTGAG 000640
000641 TCAAAATATC ACAGCATTCT TGGTAAGCCC AATTGTTTTT TCTGTTTTGC TATTTTGGTG GAGAGAAAGG AACACATAAA 000720
000721 GGAATAACAT GAGAGAAGGC TATTTGGGGA AGTGTAGTAG TTAAGGTTCT GGCTCAAACA ACAACTGCAG CTCATAAAGT 000800
000801 TGACTTTAGT GGAAGGATAC TGGGGTATCT CATGGAATCT TGGGAACTGT TGAATAACCA GGGAAACTCT GGGAAACTCA 000880
000881 CTGGTAGGAA TCCATAAACT GTCCTCCTGG TGGGCTGTAA ACAACTCACC CTCTATGCAT CTCACATCAA AATTCCAGTT 000960
000961 TCTTGGGAAA ACAAGTCTGT TTGCCCAATT TGGGTCATAT TTCCACGTCC ATGTTACTCA GGCATGATTC ATCTGCAAGT 001040
001041 TATGTGTATA GATATTTTGC TACTGTTCCA CCCTTACGCT GTGCTGGGGA GGGAGGTGTC ACTGTGAGCT GTGTCGGTGC 001120
001121 CTTAAGAGAT ATCTGTTGTG TCTTATTACT TGGTTGCTTT TCCCCACATG TACAATGACA AAAATGCCTT CAACCTATTT 001200
001201 GATCCAGCCG TTCCAGTACA ACTCCTATAC TTGCCATCTT TCCAAGCCCA AAGGTACATC CAGCTGATGG AAGGAGCATC 001280
001281 TTGGTGTTAA TATTCTTTTA GTCATGGTCT CTGAAAGTAA AATGTCTATT CTTCTAATTC TGGCACAATC TTATCTAGCT 001360
001361 ATAGTTCCTC ATGGTCCTGC ACTCCATGGA CTAAATTGTA AGTATAATTA CTACCAATGT ACTCTATAAA TAACTTTTGG 001440
001441 GGCCAGGGTG GCAATAGTTG CTAGAGAGAA AAAAAAAAAA AAGGAAGGAG AAGAAAACAG TGATAGTTCT TATTTTAAAA 001520
001521 GGAAAAAAAG AGGCAGGAGG CTCTCTTGAG GCCAGGAGTT TAAGACCAGC CTAGGCAGCA TTTCAAGACC CTGTCTCTAC 001600
001601 TAAAAAGTAA AAAAAAAATT TAGTCAGGCA TGGTGGCATG CACCTGTAGT CGTAGCTACT CAGGAGACTG AGGTGGGAGG 001680
001681 ATTGATTGAG CTCAGGAGTT TGAGGCTGCA GTGAGCAATC ATCATGCCAT TGCACTCCAG CCTGGGCATC AGAGCAAGAC 001760
001761 CTTGTCTTTT AGGAAAAAAA GGCAGGGAAG AGGAATAGGT AATTTTTCAG TGTTCAGACA TTCCAGCAAT ATGTGTGGAG 001840
001841 TACTCATTCT CACTACAGTT TATGAGGCCA TAGCTAGTAT GTATGACTAC CCATCCAAGT TTCCCTGCTT ACAGTTACTA 001920
001921 TTCCAACTGA TTGGGGGGCT TTTCCTAATA GAGTGATTTA AGCCTTCATT TTTAGACATC TAAGCCCTTG GTGATCATCA 002000
002001 GCATAAAATG TGACAAATTA AACAAAAGCA AGACAGCACA TCAGAGAACA ACTCTGAGGT GGAATGATTG GGAACCAATG 002080
002081 AATAGTTGTT CAGTAAATGG TTTATATTTT ACAGATGATG AAACTGAAAC ACAAAAAATT TAGATTAACT CTTAGGTGAC 002160
002161 AAAGCCAGGA TTGAAGCTCA TGCGGTCTGG CTCCAGAACA ACTCTTCTTC ATAGTTACGT TATACTGCCC CTGCATTGTT 002240
002241 GGTATTGAAA AATTTCCTTT CATCTCTGGT AAAAGTCAGC TCTCTAACTA CTGCATCTCA CAGCTGAACA GATAACTGAT 002320
002321 ACCGTGCTTC CAGAAGATTT TTCTAACAGT GTTTGCAAGC TATAAAATAG TGCTTTCACT TAGAAAAGGC TAGACGTGGT 002400
002401 GGTTCATGCC TGTAATCCCA GCACTTTGAG AGGCCGAGGC ACCATGCTGG GAGATAAGGA TCCAACATAA GACAAACAGT 002480
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002721 CCGTGTCATT TTAGTTACCA GAGCTCTGCA GTATAATTTG AAACCAGGTC ATGTGATTCC TCCAGTTTTG TGGTATTAGG 002800
002801 ATAGGTTTGG CTATTCTGAG TCTTTTGTGG TTCCATATAA ATTTTAGAAT TTTTTTTTTC TATTTCTGTG AAGAATGTCA 002880
002881 TTGGTATTTT GATAGGGATT GCGTTGAATC TGTAGATTGC TTTGGGTAGT ATGGACATTT TAACAATATT CATTCTTCTA 002960
002961 ATCCATGAAC ATGGAATACC TTTCCATTTT TTGGTGTCCA TTTCAATTTC TTTCATCAGT CTTATACTTT TCATTATAGA 003040
003041 GATCTTTCAC TTCTTGGATT AACTCCTATG TATTTAATTT TACTTGTAGC TATTGTAAAT GGGATTACTT TTTTTTTTTT 003120
003121 TTTTGACGGA GTTTCACCCT TGGCATCCAG GCTAGTGTGC AATGGCGCAA CCTCAGCTCA CTGCAACCTC CACCTCCCAG 003200
003201 GTTCAAGCAA TTCTCCTGCC TCAGCCTCCT GAGTAGCTGG AATTACAGGT GCCCGCCACC ACACCCGGCT AATTTTTGTA 003280
003281 TTTTTAGTAG AGACAGGGTT TCACCACGTT GGTCAGGCTG GTCTTGAACT CCTGACCTCA GATGATCTGC CCACCTCGAC 003360
003361 CTCCCAAAGT GCTGGGATTA CAGGCATGAG CCACCACTTC CAGCAAGGGA TTACTTTTTT AATCTCTTTT TCAGATTTTT 003440
003441 CACTGTTGGC ATATAGAAAT CCTACTAATT TTTGTATGTT GATTTTGTAT CCTGGAACTT TACTGAATCT GTTTATAATT 003520
003521 TGTGTATTTG TTTATAGTAG TTTTTTGGTG GACTCTTTCA GTTTTTCCAA ATATAAGATC ATATCATTGG CAAACAAGGA 003600
003601 CAGTTTGATT TCTTCTATTC CAATTTGGAT GCCTTTATTT CTTTCTGTTG TCTGATTGCT CTAGTTAGGA CTTCCAGTAC 003680
003681 TATGTTGAAT AACAGTGATG AAAGTGGGCA TCCTTGCCAT GTTCCAGATC TTAGAAAAGA GGCTTTCAGT TTTTCACCAT 003760
003761 TCAGTTTGAT ACTAGCTGTG GCAGCTTCCA TGAGAATCAC GCAGTTTGAA GAAGCATTTC ACTGAAAAAT AGGGATTGCT 003840
003841 GTTCTGGAAA GACAAAACAA TTGTCTACAA TTCTAAAGAA GAAGTGAACA CAATAATTAA ATCAATGTTA TTCTGGGTCT 003920
003921 AAAGCTTATA TTCTTAATTA CTATATTATC CCATCTTAAA ATTTTAATTT GGAAATTATA TATCTAAATA TTATAATCAA 004000
004001 TAAAGTTGAA CACACATGAT GAAGTGTGAA AAG

Predicted Small Protein

Name CCDC18-AS1_smProtein_1010:1177
Length 55
Molecular weight 5932.9182
Aromaticity 0.0909090909091
Instability index 39.4327272727
Isoelectric point 7.64862060547
Runs 11
Runs residual 0.0484848484848
Runs probability 0.0629747394455
Amino acid sequence MLLRHDSSASYVYRYFATVPPLRCAGEGGVTVSCVGALRDICCVLLLGCFSPHVQ
Secondary structure LEEEELLLLLEEEEEEEELLLLEELLLLLEEEEEHHHHHHHHEEEEELLLLLLLL
PRMN LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLL
PiMo iiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiTTTTTTTTTTTTTTTTTTTooooo